单设本科和一本区别为：投档顺序不同、对象不同、填报模式不同。

一、投档顺序不同1、单设本科：单设本科的投档顺序在提前批次之后，本科一批之前。

2、一本：一本的投档顺序在单设本科批次之后，本科二批之前。

二、对象不同1、单设本科：单设本科是面向国家级集中连片特殊困难县（区）、国家扶贫开发工作重点县（区）、省级集中连片特殊困难县（区）定向招生的招生。

2、一本：一本是普通高等学校招生全国统一考试面向全国的招生。

三、填报模式不同1、单设本科：单设本科采用平行志愿模式填报。

2、一本：一本采用顺序志愿模式填报。

单设批次和本科一批区别是单设批次是面向贫困考生的，本科一批是面向所有考生的。