一、指代不同1、印痕化石：生物遗体被完全埋葬前在沉积物中留下的印迹，由于埋葬时遗体业已消失，岩层中并未留下除印痕外的其他痕迹。

2、印模化石：外模是古生物遗体坚硬部分（例如贝壳）的外表面印在围岩上的印痕二、形成原因不同1、印痕化石：是生物遗体（主要是软体部分）因陷落在细碎屑沉积物或化学沉积物中所留下的印痕。

2、印模化石：是古生物遗体坚硬部分（例如贝壳）的外表面印在围岩上的印痕，能够反映原来生物外表的形态及构造特征。

三、作用不同1、印痕化石：腐蚀作用和成岩作用虽然使得遗体本身被破坏，但是印痕却保存了下来，而且这种印痕还常常可以反映该生物的主要特征。

2、印模化石：内模是壳体的内表面轮廓构造留下的印痕，能够反映该生物硬体的内部形态及构造特征。