厦门大学马来西亚分校的毕业证和厦门大学一样的，会注明马来西亚分校。

厦门大学马来西亚分校归由教育部直属的厦门大学全资所有，是国家“211工程”和“985工程”重点建设的高水平大学的分校，学生学习期满并达到有关培养要求的，颁发厦门大学相应的毕业证书及学位证书。 根据马来西亚高教部的要求，厦门大学马来西亚分校每年有3个本科入学时间，分别为每年的2月、4月和9月，中国学生统一在每年9月入学。