中国科学技术大学上海校区和中国科学技术大学是同一所学校，没有本质上的区别，上海校区是中国科学技术大学的一个校区。

中国科学技术大学上海校区位于上海市，是中国科学技术大学与上海市人民政府共同创办的全日制普通高等学校，涵盖了本科生、硕士生、博士生等多个层次的人才培养体系。该校区的专业设置、课程安排、师资力量等方面，均与中国科学技术大学保持一致，毕业生获得的毕业证书和学位证书也与中国科学技术大学本部相同。