清除柴油发电机水箱污垢的方法如下：首先，断开发电机的电源并且让其冷却。

然后，打开水箱盖以释放内部压力。接下来，将水箱内的污垢用清洁刷或软布清除。可以使用自来水冲洗水箱的内部，确保将污垢冲刷干净。柴油发电机水箱还应定期清洗，以防止污垢再次积累。最后，关闭水箱盖，倒入清洗剂（如环保清洗液）进行最后的清洗。确保在操作期间佩戴适当的防护装备，以保护自己的安全。