主要有以下原因：

1、南京市内高校众多东南大学位于江苏南京，而提到南京大家首先想到的大学基本都是南京大学这一985高校，由于南大太过亮眼因此同为985的东大多少有点被其光芒掩盖。

2、学校改名前后关联不大东南大学原为南京工学院是建筑老八校之一，在业内有着广泛的知名度；后续改名为东南大学难免会损失部分名气；且改名后并未以南京为名，因此知名度也有所下降。

3、没有特别鲜明的记忆点对于一所大学来说有鲜明的记忆点和特色是更能被人所熟知的，例如武汉大学的樱花、哈尔滨工业大学的军工、电子科技大学银杏大道、北大未名湖等。