基因工程专业有的大学很多，分为了农业类，理工类，还有医学类院校，这几类院校都有这个专业，因为基因工程属于生物工程专业研究的领域，而生物工程研究的方向很多，例如医学院校有这个专业，基因工程研究方向就是针对疾病研究，还有亲子鉴定等，农业大学里面这个专业主要研究方向就是农业，如何提高粮食生产等，理工院校是利用基因工程对一些仪器设备进行开发，所以各自研究方向和目的都不一样。

基因工程专业有浙江大学，东南大学，上海交通大学，清华大学等大学。