是的，线粒体DNA是位于线粒体基质中的。

线粒体的DNA是环状的。线粒体和叶绿体的DNA位都在各自的基质中。、基质（matrix）为内膜和嵴包围的空间。基质具有一套完整的转录和翻译体系。包括线粒体DNA（mtDNA），70S型核糖体，tRNAs 、rRNA、DNA聚合酶、氨基酸活化酶等。