工程档案的归类整理可以按照以下步骤进行:1.确定归档标准:根据工程项目的不同,确定归档标准,比如按照工程阶段、按照文件类型、按照时间等。

2.建立归档目录:根据归档标准,建立归档目录,可以按照文件夹的形式存放,也可以通过电子档案管理系统进行归档。

3. 分类整理文件:将工程档案按照归档标准分类整理,如设计文件、施工文件、验收文件、变更文件等。