在投标过程中，如果出现需要澄清的问题并已进行回复，一旦投标截止时间已过，一般情况下不能再更改。

因此，在回复澄清之前一定要仔细审查和确认招标文件中的所有细节，确保提交的投标文件符合要求，减少错误和漏洞的可能性。即使需要更改，也要与招标方进行沟通并获得批准，以避免未经授权的修改导致投标失效或涉及法律问题。