佳木斯大学有3个校区，分别是向阳校区、第七学区、佳木斯大学医学院。

向阳校区地址为黑龙江省佳木斯向阳区学府街148号；第七学区地址为黑龙江省佳木斯向阳区中山街535号；佳木斯大学医学院地址为黑龙江省佳木斯向阳区桥北路与通江街交口西侧。