两所学校办学层次不一样：北师大珠海分校是北京师范大学和珠海市人民政府共同筹办的，属于“独立学院”。

在广东省内招生属于本科二批A类。而北京师范大学是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的全国重点大学，是具有双一流资格的重点高校，即为985和211的大学。

主体不同，北师大珠海分校是北师大和珠海政府合办的大学，北师大是国立大学