一点个人想法，供你参考：

1、不一定要按专业划分的。

既然是工程合同，肯定有相似点、也有不同点，过去一个人能同时管三个专业的合同，就说明它们之间的不同点并不是难以逾越的。我建议是找三-四个人同时跨专业管合同，这样万一有人离职，短时间也不怕了。

2、在合同签订流程中，应该避免一个人从头签到底的情况。应当有人专门负责招投标、谈判这些前期事务性工作，另一些人专门负责合同内容审核等决策性工作。

3、在执行中的合同，可一式两份，一份由具体执行人去保管，另一份由上级主管保管，便于实时监控。执行完的合同，一份留部门内，另一份交公司保管。

4、人员编制同意你的意见。