南京工程学院排名低的原因主要是组建时间不是很长，也就二十年左右，关健是主要专业都是本系统的传统专业，都是实用型的比较多，没有研发新型高端技术专业水平，总体来说研发不够。

但应用型专业对社会的需求是必须的，所以说南京工程学院还是很好的。