有区别。

区别在于，解剖根尖孔是指牙髓腔与牙根外部之间的通道，位于牙根尖部附近。它通常是由根尖孔和根管组成的，是牙齿的一部分。生理性根尖孔是指牙根尖部附近的微小孔隙，是牙髓腔与牙根外部之间的自然连接。它通常是由牙髓组织与根周组织交界处的微小血管和神经细胞组成的。两者的区别在于解剖根尖孔是一种解剖结构，而生理性根尖孔是一种生理性通道。解剖根尖孔是固定存在的，而生理性根尖孔则是由于牙髓组织与牙根周围组织的联系而形成的自然通道。