莆田学院目前开设了艺术、人文、理工、教育四大类专业。

其中，舞蹈、视觉传达设计、环境设计、建筑学等艺术专业在福建省内有一定的知名度和影响力。人文类专业中，汉语言文学、历史学、哲学等传统文科专业与社会工作、旅游管理等新兴专业都备受学生青睐。理工类专业以计算机科学与技术、软件工程、物流管理等应用性专业较为受欢迎。教育类专业如幼儿教育、特殊教育、小学教育等具有较好的就业前景。总的来说，根据个人兴趣爱好和职业规划选择专业才是最重要的。

莆田学院王牌专业有数学与应用数学、测控技术与仪器、机械设计制造及其自动化。

另外，护理学、土木工程、工程管理、临床医学、环境工程、生物技术、计算机科学与技术、汉语言文学等，算是比较好的专业了，临床医学每年录取分最高，三个硕士点专业是新闻与传播、机械、资源与环境。