虹吸滤池是依靠池内水位和控制堰出水水位之间的高差来过滤的。

因此，经过一定时间的过滤运行，滤层的阻力增大，水头损失增加，致使滤层上的水位升高，当水位逐步升高至一定的高度时，也即水头损失到达一定的最大允许值时（一般为1.5～2.0m左右），滤池就要进行反冲洗。此时，首先破坏进水虹吸管的真空，使配水槽2的水不再进入滤池。利用真空泵和水射器使虹吸管形成真空，滤池内的水通过冲洗虹吸管和冲洗排水管排走，直至滤池内水位继续降低至环形集水槽水位以下时，就开始反冲洗。水自下而上通过滤层，冲洗的废水继续由冲洗排水管排出。而冲洗的水源是由组合中的其他几格滤池通过环形集水槽源源不断供给，直至排出水水质清洁时为止。要结束滤池的冲洗就要破坏冲洗虹吸管16的真空，可以打开冲洗虹吸管上放空气阀，让空气进入，冲洗即行停止，然后再启动虹吸管，滤池又重新开始过滤。

因为虹吸原理是水从高位往低位流，故水位不同