慕才亭由来有多种说法。

一种说法称，苏小小死后，葬于西泠桥畔，后人慕其才名，在此建墓。前有石碑，并有题字：钱塘苏小小之墓。上覆六角攒尖顶亭，名曰“慕才亭”。据传是苏小小资助过的书生鲍仁所建。另一种说法称，王韬在咸丰八年（1858年）游杭州西湖孤山时，在《漫游随录图记·西泠放棹》中叙述过慕才亭的来历：“苏小小墓在山麓，绕孤山行数百步即是，近为特鉴堂将军所修治，建亭其上，题曰慕才。”目前尚无定论，感兴趣的话可以查阅相关历史资料或咨询历史专家。

慕才亭由六根四方柱支撑，亭高3.15米。墓直径2.6米，圈高0.9米，用泰顺青石并以传统雕琢加工而成。慕才亭是西湖风景区里柱联最多的亭子。