南京二十九中创办于1945年.现已发展成为南京二十九中教育集团,由江苏教育学院附属高级中学(原二十九中高中部)、南京二十九初级中学和致远中学组成.其中南京29中教育集团是江苏省重点高中、江苏省国家级示范高中、江苏省四星级高中。

坐落在凤凰庄的致远中学是教育集团的重要组成部分（原五中初中部），2002年区划调整后成为29中公办初中的一个校区。南京二十九初级中学分为玉泉校区（初一、初二）和石城校区（初三）两个校区。