主要区别在于录取方式不同：

1、计划生是对学校招生计划的补充，学校的录取方式是以志愿为顺序，以分数为依据，择优录取，招满为止。

指标生是指部分普通高中拿出部分招生计划分配到一定范围的学校招生，计划生指计划内就是指学校通过当地高招办提档录取的学生。