基建档案的整理通常参照以下文件：

1. **国家档案法**：这是国家对档案管理的基本法规，规定了档案管理的基本原则、档案机构的职责、档案的收集、整理、保管、利用和销毁等。

2. **国家档案局发布的档案管理规定**：这些规定对档案管理的具体操作进行了详细的规定，包括档案的收集、整理、鉴定、保管、利用、统计、销毁等。

3. **行业标准和规范**：例如《建筑工程资料管理规程》、《建设项目档案管理规定》等，这些标准和规范对建筑工程的档案管理进行了具体的规定。

4. **公司内部的档案管理规定**：公司可以根据自身的实际情况，制定内部的档案管理规定，包括档案的收集、整理、鉴定、保管、利用、统计、销毁等。在整理基建档案时，需要遵循以上文件的规定，确保档案的完整、准确、系统和安全。