企业购进货物或者劳务取得的增值税专用发票已经认证对方却作废了的，企业应该对该进项税额进行转出处理。其具体的分录需要根据实际情况来进行确认，比如企业购进原材料的发票被对方作废的，企业应该做如下分录，

借：应付账款等，

贷：应交税费—应交增值税—进项税额转出。