食品工程专业的课程包括：基础课程：高等数学、大学物理、无机化学、有机化学、分析化学、生物化学、物理化学、仪器分析等。

专业基础课程：食品化学、食品分析、食品安全学、食品微生物学等。专业课程：食品工艺学、食品加工机械设备、食品工厂设计与环境保护、水产食品加工学、食品工厂企业管理、食品质量管理、食品包装学等。请注意，具体课程安排可能会因学校和专业而有所不同。