理学的在理学院，毕业获得理学学位；工学的在光电工程学院，毕业获得工学学位。

两个专业的师资完全是两套人马（即使相同名称的课例如物理光学、激光原理，也都是各自学院的老师在教）。理学的学的都是物理类课程，普物、四大力学都学，也学一点电子专业的课程，例如电子技术、电路分析。但其他的工程方面的课程就很少了，专业课叫的上号的只有物理光学、激光原理，至于应用光学那都是专业选修课。到了高年级分专业方向时都是偏物理的，例如激光科学技术、光子学与光谱技术等。工学的只学两个学期的大学物理，不学四大力学。光学、机械、电子这些工程领域的入门课基本完备，专业课更是包括傅里叶光学、光学测量、光学工艺、传感检测、光电检测、仪器制造。专业分方向都是光学设计、光学制造技术、光通信、照明这类的非常工程的方向。

理学是纯理论层面的推导与演算，证明操作的可行性，而工学主要是从实际操作出发，有理论为基础才能进行操作和运作