一、方向不同1、专业型硕士，主要工作是针对于临床工作而言的，未来的方向就是和病人直接接触的医生，专硕又被称为临床型硕士。

2、而学术型硕士，主要培养方向是该生的医学科研能力，未来的方向就是搞研究，朝医学科学家的方向发展的，所以，该类型又被称为科研型硕士。

二、环境不同1、专业型硕士在三年的学习中要在医院的各个科室学习。

2、学术型硕士大部分时间是在实验室，但至少有半年的时间临床学习。

三、证书不同1、专业型硕士毕业后可以拿到毕业证，学位证还有规培证、2、学术型硕士只有毕业证和学位证，没有规培证。

医学硕士指的是在医学专科方面取得的硕士文凭，专业硕士是本硕连读的