宝石的内部特征包括宝石的结晶学、矿物学特性；宝石的力学性质；宝石的光学性质。

其中，宝石的结晶学、矿物学特性又可以分为：化学成分、晶体结构、对称性、结晶习性等性质宝石的力学性质又可以分为：硬度、解理、裂理、断口等性质宝石的光学性质又可以分为：颜色、折射率、双折射率、色散、吸收光谱等性质除此以外，还包括内含物特征、耐腐蚀性等各种性质。