1）如果轻微不平衡，可以按照平衡方差分析来近似处理。

个数成比例时(每行比例相等且每列比例相等)也可用标准的方差分析处理。如果只有一个单元少一两个数值，可以用单元平均值补足空缺。但加入平均值不增加自由度。如果只有一个单元多一两个数值，可以随机去除任意一两个数值。方差分析完后，恢复全部数值，再随机去除一次。如果两次方差分析结果近似，就说明分析结果可靠。单元数据个数少时，增减数据的方法误差大。

2）不平衡时，加权(对均值平方和的项反比于方差加权）是可用的方法。

3）严重不平衡时，推荐使用回归模型法分析。这是最精确的分析方法。拟合模型后，可以使用一般回归显著性检验方法。