公务员年终绩效是按职务来发放的。

公务员每到年终都会发放一定数量的绩效奖，比如综治奖、文明奖、节能奖等，人社部门、财政部门都有规定，公务员在发放年终绩效考核奖的时候都是按照平时工资来发放的，职务高的平时工资就高，那年终绩效奖自然也就高。