自费升舱是允许的。

公务出差根据职务的级别，对于乘坐的航班舱位是有严格的标准要求的。对于普通企业来说，你拿升舱后的机票去财务报销，财务可以接收票据，但只能按照经济舱的票价给予报销。但对于财务制度更严格的单位来说，你拿公务舱机票去财务，财务人员是不接收的，因为超出了标准。所以为了保险起见，还是建议拿经济舱的机票然后自费进行机上升舱更好。