这两个单位有本质的区别。

代建单位是业主方的代表，是业主方请来代为进行整个工程建设全过程管理的单位，是施工项目招投标、工程建设的组织和管理单位，而施工单位是指具体的工程项目施工单位，他需要接受和服从代建单位的管理。

代建单位需要有权益人（单位）的全权委托书（公证）才能代建，施工单位可以凭签订的合同（协议）可以直接施工。