山西中医学院与长治医学院本来相差不大，但是，山西中医学院2015年开始成为国家中医药管理局与山西省人民政府共建的省部共建大学，2016年3月山西中医学院即将升格更名为山西中医药大学，加上地处省会太原，这样一来，两个大学的综合距离就明显了。

如果半年后问此问题的话，将会出现有人“一个大学，一个学院，不是一个档次”类似的回复。然而，个人认为普通二本大学专业最重要，个人觉得学西医就业、发展、适用范围宽广一些。