在本质上毕业的大学生人事档案存放在市级还是县级是没有区别的，只是说如果存放在市级的人事管理部门的话，理论上说安全性要高一些，将来如果要考取事业编制或者进入公务员队伍的话，调取人事档案比较方便，也不容易丢失罢了。