税务机关对新认定的小型商贸企业一般纳税人实行辅导期管理，叫做辅导期一般纳税人。

辅导期一般纳税人和正式一般纳税人最大的区别是对收取的增值税抵扣凭证实行“先比对，后扣税”。“先比对，后扣税”是指辅导期一般纳税人企业取得的增值税进项发票认证后，先通过防伪税控系统将认证信息上传至总局进行比对，总局比对结束后将比对结果下发各省市，各主管国税局将比对无误的信息通知辅导期一般纳税人企业进行抵扣（在认证的次月收到比对结果）。