如果公务员在任职期间从事违规经商活动被发现，将面临严重的纪律处分和法律风险。

根据公务员法规定，公务员不得利用职权谋取个人利益，从事与职责无关的经商活动。如果违反规定，将被给予警告、记过、降级、撤职等纪律处分，甚至可能涉及法律责任。此外，公务员从事经商活动还会影响公众对公务员的信任度和形象，对于公务员的职业道德和职业操守也会造成不良影响。