专项施工方案和专项应急预案的区别在于，专项施工方案指的是工程项目建设单位制定的对某一专项工程的施工计划，安排，施工技术，完成施工任务的措施等等，而专项应急预案则指的是对有可能发生的专项重大事件预先做出的急紧救援的安排，措施等。