本科招生目前仅有两个专业，一个是临床医学（八年制）专业，另一个是护理专业。

凡志愿报考协和“临床医学（八年制）”专业的考生，在填报志愿时应报清华大学临床医学专业，并可同时报清华大学其他理工类专业。护理学专业学制四年，男女兼收，由北京协和医学院招生，在报考的时候应该填报北京协和医学院。