横琴自贸区封关后货物将通过陆路、水路等多种交通方式出入境，并在配合各项出入境手续，如海关联检、核销等后顺利进出口。

同时，横琴也通过推行跨境电子商务、进一步优化物流体系、建设物流园区等措施，提升海关清关效率，加快货物进出速度，推动贸易便利化。