保卫科和门卫是一个部门。

门卫属保卫科领导，担负着单位进出人员观察，及收发信件、是安保工作的一部分，保卫科直接属单位领导指挥，对单位区域的生产，原料，仓储，设备，以及人员的安全运行，做保障工作，日常的环境，状况，及人员动态做好汇总登记，整理资料，上报单位领导人，使领导掌握全面情况。

保卫科和门卫不是同一个部门，保卫科是掌管门卫和单位或者公司的安全的一个总体体部门，一个是管理者一个是服务者

保卫科和门卫是一个部门。门卫隶属于保卫科管理。保卫科是对整个单位进行内、外、安技等事情进行安全保卫和全员进行安全管理的。门卫是保卫科下属的一个保卫岗位。主要负责对进、出管区内的人员进行询问或盘查，以免造成不必要的损失或灾害。