不影响的。

团员档案遗失,原则上须持原毕业学校团委出具的证明(证实是团员,并写明何时何地入团)到团委补办。补办的话是联系初中学校进行补办。不补的话也没有什么影响。大学也可以重新入团。不补办没有团关系材料没法认定你团员身份，会影响到之后的入党。