微生物考研方向主要有：资源与应用微生物学、病源微生物学、微生物发酵与代谢工程、生物防治微生物学、环境微生物学、真菌学等专业。

学校有：山东大学、复旦大学、北京大学、中国农业大学、华中农业大学、中山大学、南开大学、清华大学、浙江大学、南京农业大学、西南大学等大学。