建造师两个专业可以同时申请继续教育。

理由如下:依据注册建造师继续教育规定，注册建造师在一个注册周期内(3年)必须完成规定学时的建造师继续教育培训课程(120课时），建造师每增项一个专业，必须额外增加60学时的继续教育培训课时，即每个专业30学时基础课时，30学时专业课时。