一、两者的编制情况不同：

1、聘任制公务员具有行政编制。

2、普通公务员指的是委任制公务员，其不具有编制。

二、两者的相关规定不同：

1、聘任制公务员要按照公务员法和聘任合同进行管理。

2、委任制公务员应当按照管理权限和规定的程序任免其职务。

三、两者的优势不同：

1、聘任制公务员的优势：(1)合同管理丰富了单位管理手段，在适度增加公务员职业危机感的同时也激发了其工作动力，提高了管理效能。

（2）“社会基本养老保险加职业年金”的养老保障制度对公务员相关权益的保障更加科学充分，也降低了单位“二次选人”和公务员“二次择业”成本，有利于促进人才在机关和企业、事业单位间流动。

（3）与委任制公务员同工同酬并有均等的晋升机会，保障了聘任制公务员职业发展空间，有利于吸引和激励公务员长期、勤勉为政府服务。

2、普通公务员的优势：任用权力高度集中，充分体现上级机关和领导的用人权，有利于治事与用人的统一，有利于在行政机关中贯彻首长负责制，有利于上级对下级的统一指挥调度，保障政令贯彻执行的效率。在委任制情况下，公务员非因法定事由不被免职和辞退，有利于公务员队伍的相对稳定，有利于行政管理的连续性、稳定性和专业性。委任制公务员中，主任科员以下及其他相当职务层次的非领导职务公务员，则坚持“凡进必考”的原则，考录工作也不是由各用人机关自行组织实施，而是由中央或省级公务员主管部门负责组织。对委任制公务员只能依据公务员法进行管理，委任制公务员非因法定事由、法定程序不被免职、降职和辞退，保留公务员身份直至退休。

区别在于选拔和聘任的方式不同。

聘任制公务员是指通过面试、考试等方式招聘人员，聘用期限较短，一般为1-3年，之后需要重新评估和聘用。聘任制公务员一般属于事业单位，聘用的过程比较灵活，可以根据工作需要随时调整人员配置，但是聘任制公务员的工作稳定性较差，福利待遇和发展空间也相对较低。

委任制公务员是指由上级政府部门委派或任命人员担任的公务员，属于政府机关的正式工作人员。委任制公务员的选拔和聘任一般比较严格，需要通过考试和面试等方式选拔，聘用期限较长，一般为5-10年，之后可以续聘或者晋升。委任制公务员的工作稳定性和福利待遇相对较好，但是晋升机会相对较少。

总的来说，聘任制公务员更加灵活，适合短期项目或者工作需要变化较大的情况，而委任制公务员更加稳定，适合长期的政府工作。