南京市市级机关是指南京市政府及其市管部门，包括以下部门：

1.市政协

3.市发展改革委员会

4.市经济和信息化局

6.市财政局

7.市教育局

8.市科技局

南京市市级行政事业单位名单1、南京市委办公厅，2、南京市委组织部，3、南京市电教中心，4、南京市老干部活动中心，5、南京市委宣传部，6、南京市委老干部局，7、南京市委统战部，8、南京市人大办公厅，9、南京市政府办公厅，10、南京市政府驻外机构服务中心，11、南京市企业改制上市管理办公室等等