南京环保认证单位有很多。

南京是一个大城市，有很多企业和机构都需要进行环保认证，因此在南京有很多环保认证单位。同时，南京政府也在大力推动环保工作，所以也有很多政府部门和社会组织开展环保认证工作。南京市环保局、江苏省环保科学研究院、南京市环境监测中心等都是南京比较知名的环保认证单位。此外，还有一些专业的第三方机构和检测机构也提供环保认证服务。需要注意的是，环保认证的标准和要求是非常严格的，企业和机构需要根据自身的情况选择合适的认证单位进行认证。