商业地产改公寓手续办理顺序：房管局--城管局--工商局--环保局/交通局。

在房管局办理房屋用途和结构变更审批手续。在城管局办理动工报备手续。在工商局办理经营内容变更手续。在环保局/交通局办理公寓建造或改建垃圾处理运输手续以及上下水处理审批手续。

向自然资源和规划局申请——自然资源和规划局同意并报请县级以上人民政府批准——城建部门办理建设工程许可证。