1、事业单位在申办名称变更登记、注销登记手续时，登记管理机关须收缴该单位印章，并在《事业单位法人变更登记申请书》或《事业单位法人注销（备案）登记申请书》备注栏目内注明“印章已收缴”，双方办事人员分别签字确认。

2、登记管理机关应适时与市公安局治安总队或所在地公安分（县）局治安支（大）队联系，填写《上海市公安局收缴印章收据》，将所收缴的事业单位印章，移交由公安部门统一销毁。

3、可见事业单位废弃公章由登记机关收缴交公安机关销毁。

事业单位废弃的公章要销毁处理。

销毁了。按照要求需要销毁。