哎，怎么说呢，两个学校都很强大，理论上，南京大学在全国性高校里排名更高，是教育部直属全国重点大学，位列“双一流”A类，211-985工程重点建设高校。

学校有仙林，鼓楼，浦口，苏州四个校区。东南大学也是教育部直属的全国重点大学，“双一流”A类大学。在全国排名稍逊于南京大学。南京大学和东南大学都起源于清末的三江师范学堂。两校渊源历史深厚，都是优秀大学。

两个大学都是国家211和985大学都是重点大学，南京大学名次排在东南大学前面，南京大学建校己有一百一十多年了，而东南大学的前身是南京工学院。