学院目前设中医基础医学、中医临床医学、针灸推拿学3个系，设置中医学、针灸推拿学2个本科专业；中医学专业于2011年成为硕士学位授予一级学科。

现设17个教研室，1个实验中心，1所附属蒙中医院，20所临床教学实习医院。在校全日制本科生1400余名，硕士研究生近百名。

内蒙古最有名的是内蒙古医科大学