校区之间隔的最远的应该是哈尔滨工业大学的校本部和深圳校区。

但是，我个人认为这不能算两个校区，因为哈工大和哈工大（深圳）是分开招生的，所以，真正校区隔的最远的是兰州大学的城关校区和榆中校区，兰州大学榆中校区在兰州市榆中县夏官营镇，距离校本部40多公里。