国家级一流本科专业建设点：医学信息工程，省级一流本科专业建设点：医学影像学、中药资源与开发、医学检验技术。

另外，甘肃中医院大学的针灸推拿学，中西医临床医学，临床医学，中医学，护理学，医学信息工程，中药学是省级一流专业。其中中医学的学科评估结果是C。

甘肃中医药大学一本专业共5个：中医学专业（5年制）、中医学专业“5+3”一体化（本硕连读）、中西医临床医学、针灸推拿学。

甘肃中医药大学一本本科专业建设点名单有（国家级+省级），其中有3个本科专业入选国家级一流本科专业建设点：分别是中医学、中西医临床医学、中药学。

4个本科专业入选省级一流本科专业建设点：预防医学、藏医学、中草药栽培与鉴定、康复治疗学